上篇文章讲到如何使用salmon快速进行定量分析,这回讲解如何将定量结果导入到DESeq2软件中进行差异分析。Salmon下游分析主要有:
differentialtranscriptusage(DTU)差异转录本的使用differentialgeneexpression(DGE)差异基因表达分析这里主要介绍差异基因表达分析,DTU分析可参考:Swimmingdownstream:statisticalanalysisofdifferentialtranscriptusagefollowingSalmonquantification[1]或者